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Creating tarballs the parallel way

Dear Users,

Creating tarballs may sometimes have taken some of your patience, occasionally. Compressing directories is especially useful when prior to transfer or archiving. Well, this too can be done in parallel. We just created a wiki entry on the topic.

Your HPC-Team

MOGON II weiter an der Spitze deutscher Hochleistungsrechner

09.07.2018: Der Mainzer Supercomputer MOGON II weiterhin an der Spitze der schnellsten Hochleistungsrechner an deutschen Universitäten und unter den 100 schnellsten Supercomputern der Welt.

Die Johannes Gutenberg-Universität Mainz (JGU) hat 2016 und 2017 die zwei Phasen des Hochleistungsrechners MOGON II in Betrieb genommen, der mit einer Rechenleistung von zwei PetaFLOPS respektive 2.000.000.000.000.000 Gleitkommaoperationen pro Sekunde in der Liste der weltweit 500 schnellsten Rechner im November 2017 auf Platz 65 startete und auch im Juni 2018 mit Platz 87 noch unter den 100 schnellsten Rechnern der Welt rangiert. Damit ist der Mainzer Supercomputer zugleich weiterhin der schnellste Hochleistungsrechner an einer deutschen Universität. In der Liste der energieeffizientesten Supercomputer wird MOGON II weltweit nun auf Position 62 geführt (November 2017: Position 51). Der Name MOGON wurde in Anlehnung an das römische Mogontiacum, dem lateinischen Namen der Stadt Mainz gewählt.

Die Landesregierung, der Bund, die Johannes Gutenberg-Universität Mainz und das Helmholtz Institut Mainz (HIM) haben seit 2016 insgesamt 10,6 Millionen Euro in den neuen Hochleistungsrechner investiert, um die rheinland-pfälzischen Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler im Rahmen der Allianz für Hochleistungsrechnen Rheinland-Pfalz (AHRP) bis 2020 mit Rechenleistung der internationalen Spitzenklasse zu unterstützen.

Archiving from Mogon II

Dear Users,

we have set up our archiving scripts on Mogon II, such that the Mogon I and II setup is identical.

You will find further information in our wiki.

Your HPC Team

Frühjahrsputz / spring-cleaning

Dear Users,

A penny saved is a penny got.

Therefore: Many homedirectories still contain an old directory named "lc2.home". This, lc2 users might recall, is the transferred content from the old lc2 cluster. We would like you to consider to either delete the old stuff or to archive it.

The same is true for a number of old "lc2.<projectname>" directories in the respective project directories.

Documentation concerning archiving from mogon can be found here: https://mogonwiki.zdv.uni-mainz.de/dokuwiki/archiving:tsm

Why should you care?

  • You save some bits of your file system quota.
  • You adhere to the DfG or BMBF requirements (or other parties requireing you to backup data).

Your HPC team

Troubleshooting 101

Dear Users,

In order to shoot your troubles (with job scripts) you ought to know first. Right? Alas, SLURM is a little bit obfuscating sometimes when job scripts do not use proper job steps. Some hints can be found in our wiki.

Also, be sure to check for available modules rather than compiling standard software yourself. In case some software is missing, you may use our little form to ask for a software or library to be installed. When you report issues with a software we installed - at least we know what you are talking about.

Best,

Your HPC Team